Bioinformata Júnior

Descrição

Resumo da Vaga: O Cidacs/Fiocruz Bahia procura um Bioinformata Júnior para atuar em um projeto nacional estratégico, definindo arquiteturas e implementando pipelines em HPC para um repositório nacional de dados genômicos. Principais Destaques: 1. Atuar em projeto nacional estratégico com dados genômicos. 2. Colaborar em ambiente de alta complexidade técnica. 3. Desenvolvimento profissional em equipe multidisciplinar. Você é um(a) **bioinformata** em início de carreira, com vontade de aprender, crescer profissionalmente e atuar em um ambiente de alta complexidade técnica? Gosta de trabalhar com dados genômicos, aprender novas ferramentas e contribuir para a construção de soluções que farão parte de um projeto nacional estratégico? Então esta vaga pode ser para você. O Centro de Integração de Dados e Conhecimentos para Saúde (Cidacs/Fiocruz Bahia) está recrutando um(a) **Bioinformata Júnior** para atuar no Piloto do Repositório Nacional de Dados Genômicos do **Programa Genomas Brasil**, projeto prioritário do Ministério da Saúde/DECIT. Você fará parte de uma equipe multidisciplinar responsável pela criação da base técnica, metodológica e arquitetural que dará origem ao r**epositório nacional que integrará dados genômicos, fenotípicos e clínicos** de projetos financiados pelo DECIT. Sua atuação será estratégica: você definirá arquiteturas, implementará e validará pipelines modernos em HPC, estabelecerá padrões de qualidade para sequências e metadados, e liderará a publicação de catálogos, ontologias e esquemas de versionamento e reprodutibilidade — seguindo padrões GA4GH e melhores práticas globais. A **vaga poderá ser REMOTA ou presencial**, na sede do CIDACS localizada no Parque Tecnológico da Bahia – Edifício Tecnocentro, Rua Mundo 121, Trobogy. **Responsabilidades e atribuições** * **Apoio no desenho e implementação de pipelines de bioinformática**: Colaborar no desenvolvimento e na execução de pipelines reprodutíveis (pré\-processamento, alinhamento, chamadas de variantes), utilizando containers e aprendendo melhores práticas internacionais (GATK Best Practices, nf\-core), sempre com supervisão da equipe mais experiente. * **Suporte na definição de métricas e painéis de QC:** Apoiar a equipe na verificação da qualidade de sequências (FASTQ/BAM/VCF) e metadados clínico\-fenotípicos, auxiliando no cálculo de métricas, organização de relatórios e identificação inicial de possíveis inconsistências. * **Auxílio em rotinas de automação**: Contribuir para a criação e manutenção de rotinas automatizadas para ingestão e validação de dados, seguindo modelos, scripts e frameworks já utilizados pela equipe, com foco em padronização e eficiência. * **Apoio à consolidação de catálogos e metadados**: Participar da organização e atualização de catálogos de variantes e metadados, ajudando em tarefas de indexação, versionamento e harmonização de informações conforme ontologias e padrões reconhecidos. * **Colaboração na elaboração de Procedimentos Operacionais Padrão (SOPs)**: Ajudar na preparação de documentos técnicos, guias e templates, contribuindo para a padronização e reprodutibilidade dos processos, com orientação da equipe técnica. * **Participação na documentação dos processos e pipelines**: Auxiliar na criação e manutenção da documentação das soluções implementadas, garantindo clareza, organização e apoio ao trabalho da equipe, contribuindo para a rastreabilidade e evolução futura dos processos. **Requisitos e qualificações** \- **QUALIFICAÇÕES E REQUISITOS OBRIGATÓRIOS:** \- *******FORMAÇÃO:*** * Graduação completa em Bioinformática, Biologia, Biotecnologia, Computação, Engenharia Biomédica ou áreas correlatas OU especialização/mestrado em áreas relacionadas à genômica, biologia computacional ou análise de dados biomédicos. ***EXPERIÊNCIA:*** * Experiência prévia de pelo menos 1 ano em bioinformática (projetos acadêmicos, iniciação científica, estágios, ICs, TCCs, participações em laboratórios ou grupos de pesquisa). * Experiência básica com pipelines ou etapas bioinformáticas (pré\-processamento, alinhamento, chamadas de variantes). * Participação em projetos ou atividades envolvendo dados genômicos, exoma ou painéis — acadêmicos ou profissionais. ***HABILIDADE TÉCNICAS:*** * Conhecimento inicial de Nextflow e/ou WDL/Cromwell, com disposição para aprofundamento e aprendizado prático. * Familiaridade com ferramentas essenciais: BWA, samtools/bcftools, Picard, FastQC, mesmo que aplicada em contextos acadêmicos. * Interesse e noções básicas sobre ontologias biomédicas (HPO, SNOMED, OMOP) ou metadados clínicos. * Experiência inicial com containers (Docker ou Singularity/Apptainer). * Noções de QC e curadoria de dados genômicos (ex.: uso de FastQC, MultiQC). * Conhecimento básico de ambientes Linux e Shell Script. * Familiaridade com Git e versionamento de código. * Interesse em aprender sobre execução em HPC (SLURM, filas, quotas). ***HABILIDADE INTERPESSOAIS:*** * Boa capacidade de organização e aprendizado contínuo. * Abordagem analítica e curiosidade científica. * Facilidade para trabalhar em equipe multidisciplinar. * Comunicação clara e abertura para receber orientação técnica. \- **DESEJÁVEIS, MAS NÃO OBRIGATÓRIOS:** \- ***OUTRAS QUALIFICAÇÕES:*** * Conhecimento introdutório sobre padrões GA4GH (ex.: já ter lido ou utilizado Phenopackets, DUO, htsget). * Experiência prévia com ferramentas de coleta e organização de dados clínicos/fenotípicos (ex.: REDCap). * Inglês básico ou intermediário para leitura de documentação técnica. ***DIFERENCIAIS:*** * Publicações acadêmicas, posters ou apresentações em eventos científicos. * Participação em competições, hackathons ou cursos avançados de bioinformática. **Informações adicionais** **SOBRE O PROJETO:** Nos próximos 24 meses, vamos transformar milhares de sequências genômicas dispersas em um repositório nacional vivo, seguro e interoperável — com pipelines Nextflow/WDL executando em HPC, controle de qualidade rigoroso e metadados harmonizados. Estamos construindo o primeiro piloto do Repositório Nacional Genômico, integrando dados genômicos, fenotípicos e clínicos provenientes de projetos financiados pelo DECIT/MS, criando a base para pesquisas em saúde pública, vigilância genômica e medicina de precisão. Buscamos pessoas inquietas, altamente técnicas e comprometidas com a ciência aberta e o uso ético de dados sensíveis que desejam contribuir para uma das iniciativas mais estratégicas do país em genômica humana. **SOBRE O CIDACS:** O CIDACS é um centro pioneiro na integração de dados, focado em entender, estudar e avaliar as condições de saúde da população brasileira por meio de Big Data. Nosso trabalho auxilia gestores públicos, pesquisadores e a comunidade, contribuindo para transformar vidas. Se você, assim como nós, é apaixonado por tecnologia e inovação, junte\-se ao nosso time. Aqui, você encontrará um ambiente acolhedor, propício para desenvolvimento e inovação, repleto de profissionais de diversas formações acadêmicas unidos por um propósito. Aqui você encontrará: * Um ambiente acolhedor e colaborativo; * Profissionais altamente qualificados e multidisciplinares; * Infraestrutura de ponta (HPC, data lake seguro, TRE); * Incentivo à inovação, formação contínua e autonomia científica. Se você é apaixonado por bioinformática, automação e desafios complexos, venha fazer parte dessa missão. Traga seu talento e comprometimento e venha fazer parte desse time! Mais informações sobre o Cidacs, acesse: www.cidacs.bahia.fiocruz.br O Cidacs conduz estudos e pesquisas baseados em projetos interdisciplinares originados na vinculação de grandes volumes de dados para ampliar o entendimento dos determinantes e das políticas sociais e ambientais sobre a saúde da população.